M. J. Jiménez Rodríguez, B. Medrano Garfia
El proceso de segmentación de una imagen microscópica de tejido epitelial generalmente produce una partición de la imagen en diferentes regiones. En trabajos anteriores se ha realizado un análisis topológico de la organización de las células en estas imágenes, en los que, implícitamente, se realiza una aproximación de las regiones de las células por las regiones de Voronoi de sus centroides. Nosotros proponemos un enfoque alternativo: consideramos el grafo de contacto (centroides como vértices y regiones vecinas como aristas) y construimos una filtración sobre el complejo simplicial inducido por dicho grafo, considerando la intersección de bolas crecientes centradas en los centroides con las propias regiones. Esta idea se inspira en la forma en que se construyen los complejos alfa, donde se consideran las intersecciones de las bolas con las regiones de Voronoi correspondientes. Comparamos los barcodes obtenidos por ambos enfoques y analizamos las ventajas de esta nueva aproximación.
Keywords: Homología persistente, mapa de segmentación, tejidos epiteliales, organización topológica de regiones.
Scheduled
RSME-SEIO Invited Session: Topological Data Analysis
June 10, 2022 10:10 AM
A16
